e-Taxで申告書等を提出する場合，ダイレクト納付の届出をしておくことで，期日指定による口座引き落としが可能だ。令和2年分は確定申告の期限延長により，延長後の納期限内に引き落とし日を指定することができるが，e-Taxでの操作手順がいつもと異なる。

ダイレクト納付とは，e-Taxで申告書等データを送信した後に，預貯金口座からの振替により，即時又は指定日に国税を電子納付することができる手続のこと。原則，確定申告における納期限は，申告所得税・贈与税が3月15日，個人事業者の消費税等が3月31日だが，令和2年分は期限延長により，いずれの税目も令和3年4月15日が納期限となる。

納期限内に期日を指定する場合，通常の確定申告における操作手順では，納税者はe-Taxで申告書等データを送信した後，メッセージボックスに格納される納付区分番号通知の「ダイレクト納付」から「納付日を指定される方」を選択し，期日を指定することとなる。

ただ，システムが延長後の納期限に適応していないため，同手順で進めても，申告所得税・贈与税は令和3年3月16日以降の納付日を，個人事業者の消費税は令和3年4月1日以降の納付日を，指定できないという。

したがって，延長後の納期限内に期日指定をしたければ，令和2年分の確定申告における操作手順において，納税者は，申告書等データ送信前に税目，納付の目的となる課税期間，申告区分，納付金額等の「納付情報データ（納付情報登録依頼）」を作成する必要がある。データの作成・送信後は，メッセージボックスに格納される納付区分番号通知の「ダイレクト納付」から「納付日を指定される方」を選択することで，延長後の納期限内に期日を指定できるという。