令和3年度の電子帳簿等保存制度の改正で，帳簿書類の電子保存につき税務署長の承認が不要となったことを踏まえ，国税庁は，法人や個人事業者の青色申告の承認取消しに関する改正事務運営指針を公表した（令和3年11月30日「「法人の青色申告の承認の取消しについて」の一部改正について（事務運営指針）」等）。

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