適格請求書発行事業者の登録申請書は、令和4年度改正内容を受けて一部見直しが行われ（ №3699 ）、令和4年9月20日から改正内容を反映した「新様式」でe-Taxによる送信が可能となっています。

令和4年10月11日以降、「旧様式」での送信対応が終了したため、提出できなくなりました。新様式に対応したソフトウエアのダウンロードやバージョンアップが必要になります。